A honvédelmi szervezetek fő célkitűzéseit és feladatait tartalmazó honvédelmi miniszteri utasítás a Hivatalos Értesítő legfrissebb számában jelent meg. Ebben Hende Csaba honvédelmi miniszter a honvédelmi szervezeteket érintő célokat 20, míg a feladatokat 47 pontban összegezte. A honvédelmi szervezetek 2013-as fő feladatai között számos országgal való szorosabb együttműködés szerepel. Így például a műveleti területen történő együttműködés fejlesztése Németországgal, valamint az Egyesült Államokkal. A magyar–svéd együttműködés keretében a Gripen repülőgépek folyamatos műveleti alkalmazásához szükséges feltételek biztosításában, Szlovéniával pedig a NATO Hegyi Hadviselési Kiválósági Központ 2015-re tervezett felállításával összefüggésben vannak erre az évre feladatai a honvédségnek.
Grúziával, Kazahsztánnal, Tádzsikisztánnal és Üzbegisztánnal tárca szintű katonai együttműködési megállapodásokat terveznek. Az Oroszországi Föderáció és a magyar kormány között egy, a kétoldalú haditechnikai együttműködés során végzett szellemi tevékenység eredményeihez fűződő jogok kölcsönös védelméről szóló nemzetközi szerződés előkészítése a feladat. Az utasításban a feladatok között szerepel továbbá a felső szintű kapcsolatok fenntartása mellett a szakértői szintű együttműködés kiszélesítésének folytatása Kínával, valamint a magyar–indiai kapcsolatok továbbfejlesztése is.
A Magyar Honvédség az idén több gyakorlatban vállal szerepet, például az amerikai Ohio Nemzeti Gárdával megrendezendő válságkezelő és katasztrófa-elhárítási gyakorlatban, a Lengyelországban tartandó NATO NRF Steadfast Jazz 2013 manővergyakorlatban és a „Lendülő Kard 2013” légvédelmi éleslövészettel egybekötött gyakorlatban vagy a „Capable Logistician 2013”, „MOVCOM MILU 2013”, a „Joint Logistics 2013” nemzetközi gyakorlatokban. Hende Csaba utasításában előírja azt is, hogy az afganisztáni műveleti területről felszabaduló erőforrások figyelembevételével dolgozzanak ki javaslatokat a balkáni műveletekben való magyar szerepvállalás esetleges növelésére, valamint vizsgálják meg az ENSZ műveleteiben való hangsúlyosabb magyar részvétel lehetőségeit.