A tervek szerint átalakul az Országos Tisztifőorvosi Hivatal (OTH), átalakul a Gyógyszerészeti és Egészségügyi Minőség- és Szervezetfejlesztési Intézet (GYEMSZI) szervezeti struktúrája, a jövőben Állami Egészségügyi Ellátó Központ (ÁEEK) néven tevékenykedik tovább. Többletfeladatokat kap az Országos Egészségbiztosítási Pénztár (OEP), megalakul – két intézmény összevonásával – az Országos Gyógyszerészeti és Élelmezés-egészségügyi Intézet, továbbá az Országos Igazságügyi és Orvostani Intézet feladatait a Semmelweis Egyetem veszi át.
Megmarad – mint középirányító szerv – az OTH, de a korábbi kilenc háttérintézménye helyett a jövőben négy fog tevékenykedni.
Az OTH háttérintézményeként jön létre az Országos Közegészségügyi Központ, amelyhez a környezet- és település-egészségügy, sugáregészségügy, valamint a kémiai biztonság tartozik majd. Integrálódik az Országos Kémiai Biztonsági Intézet, Országos „Frédéric Joliot-Curie” Sugárbiológiai és Sugáregészségügyi Kutató Intézet, valamint az Országos Környezetegészségügyi Intézet.
Szintén az OTH háttérintézményeinek integrációja útján jön létre a Nemzeti Egészségfejlesztési Intézet az Alapellátási Intézetnek és az Országos Gyermekegészségügyi Intézetnek az Országos Egészségfejlesztési Intézetbe történő beolvadásával.
A Nemzeti Egészségfejlesztési Intézet módszertani intézetként és egészségfejlesztési szolgáltatási központként látja majd el feladatait – áll az összefoglalóban.
Az országos intézetek egymással való együttműködését az OTH megerősített koordinatív hatáskörrel fogja ellátni, és megmarad az Egészségügyi Készletgazdálkodási Intézet (EKI), amely az OTH középirányítói jogkörébe kerül. Az összeolvadások szükségszerűen jelentik a párhuzamosságok megszüntetését és profiltisztítást, azonban leszögezték, hogy az átalakítás során az alapvető feladatok elvégzése nem sérülhet, és a folyamatos működés fenntartása, a kötelező állami feladatok ellátása is prioritás.
A Gyógyszerészeti és Egészségügyi Minőség- és Szervezetfejlesztési Intézetből (GYEMSZI) létrejön az Állami Egészségügyi Ellátó Központ (ÁEEK), amely kizárólag a fenntartói, az állam tulajdonosi joggyakorlási funkciókra összpontosít. A hatósági feladatok a háttérintézményi rendszer más szereplői részére kerülnek átadásra.