A Sportske novosti című horvát újságnak nyilatkozó 28 éves csatár így fogalmazott: „Csalódtam ebben az emberben, mert nem nem volt méltányos velem szemben. Nem érdekelte, hogy a legjobbamat nyújtottam a csapatért, a klubért, úgy döntött, hogy a német kupa fináléja előtt kihagy a keretből.” Ezek után igazolt Mandzukic 22 millió euróért a némettől a spanyol bajnokhoz, így a szakvezető megakadályozta, hogy volt játékosa a posztjára érkező lengyel Robert Lewandowski vetélytársa legyen a Bundesliga gólkirályi címéért. „Pedig ez a cím számomra kevésbé fontos, de az eset jól mutatja, Guardiola mennyire inkorrekt volt velem szemben, és csak meg akart tőlem szabadulni.”
Mandzukic 88 tétmérkőzésen 48 gólt ért el a Bayern München színeiben, s további 14-et más találkozókon, rengeteget tett a gárda 2012–13-as triplázásáért (BL, bajnokság, kupa) és 2013–14-es duplázásáért (bajnokság, kupa), mégsem illett bele a tréner elképzeléseibe. Ám erről az érintett mit sem tudott. „Értékeltem volna, ha egyszer odajön hozzám, és azt mondja: »Hallgass ide, Mario, ne haragudj, de nem férsz bele a játékrendszerembe, más támadóra lenne szükségem.« Nem tette.”
Barcelonai tevékenysége alatt Guardiolának hasonló problémája támadt egy másik kiváló csatárral, a klubrekordért szerződtetett Zlatan Ibrahimoviccsal, akit egyetlen év után visszaküldött Olaszországba, a Milanhoz. A svéd klasszis sem rejtette véka alá a véleményét volt tréneréről: „Egészen biztosan a miénk volt a világ legjobb csapata, ám megakadályozott minket a Bajnokok Ligája megnyerésében, hogy valaki rossz döntéseket hozott. Guardiola nagyszerű edző, de gyenge ember, egy senki.”
