2009 decemberében a legfelsőbb bíróság megsemmisítette azt az amnesztiarendeletet, amely 2007-ben mentesítette többek között a majdani elnököt, Zardarit a korrupció miatti eljárás alól, főként abban az ügyben, amely közpénzek elsikkasztásáról, svájci bankszámlákra való kimenekítéséről szól.
„A miniszterelnöknek január 19-én személyesen meg kell jelennie a bíróság előtt” – áll a héttagú testület hivatalos hétfői értesítésében, amely a bíróság megsértésében, utasításának semmibevételében elmarasztalja a kormányfőt.
2007-ben az akkori elnök, a nagy nehézségekkel küszködő Pervez Musarraf – saját bevallása szerint – titkos szövetséget kötött Benazir Bhutto volt miniszterelnökkel, az ellenzék emigrációból akkor hazatért vezetőjével a hatalom jövőbeli megosztásáról a 2008-as választások alkalmával. Ennek érdekében rendelt el több mint nyolcezer emberre – köztük Bhutto asszonyra és férjére, Zardarira – kiterjedő amnesztiát, mentesítést minden korrupciós vád és eljárás alól.
A miniszterelnöki poszt várományosát, Benazir Bhuttót ezután 2007. december 27-én meggyilkolták, s miután pártja nagyarányú győzelmet aratott a 2008. februári törvényhozási választásokon, özvegyét, Zardarit választotta meg az új parlament az ország államfőjévé. 2009 végén azonban a legfelsőbb bíróság törölte Musarraf amnesztiarendeletét, és utasította a kormányt, hogy újíttassa fel a korrupciós pereket számos politikai személyiség, köztük Zardari ellen. A kormány ezt nem tette meg.
