A viszontagságok miatt a klub sokáig pénzügyi nehézséggel küzdött. A megváltó Azerbajdzsán legnagyobb vállalatának, az állami tulajdonú Azersun Holdingnak a képében 2001-ben jött el. A financiális háttér megteremtése után az építkezés következő lépcsőfoka Gurban Gurbanov leigazolása volt. Az ország korábbi futballsztárja 2008-ban vette át a szakvezetői pozíciót, és formálta az ország legjobb csapatává a Qarabagot. Eddigi regnálása alatt tanítványai három alkalommal harcolták ki az Európa-liga-csoportkörbe jutást, és 2014-ben, 21 év után megnyerték az első osztály küzdelmeit, azóta pedig minden évben ők végeztek az első helyen.
Az idén augusztusban újra szintet léptek: a Bajnokok Ligája play-off körében előbb hazai pályán 1-0-ra legyőzték a Köbenhavnt, majd ugyan Dániában 2-1-es vereséget szenvedtek, de az idegenben lőtt gólnak köszönhetően első azeri együttesként eljutottak a csoportkörig. – Azt hiszem, Isten is segített elérni ezt. A lefújás után elkezdtem könnyezni, nem tudtam visszafogni az érzelmeimet. Erre a pillanatra vártunk évek óta – mondta a továbbjutás után Gurbanov mester.
