Mint mondta, al-Baghdadi és Zawahiri közt az egyik legfontosabb különbség, hogy míg az utóbbi is külföldi harcosokat próbált összeszedni, más módon tette, mint al-Baghdadi: számára a csúcs az lehetett, amikor egy hónap alatt körülbelül 150 harcost tudott toborozni egy tucat országból. Ám al-Baghdadi ugyanennyi idő alatt 1500 embert volt képes a zászló alá gyűjteni 100 nemzetből. Ő az információs kor modern fegyvereit használva alapvetően más módon erősíti az ideológia vonzerejét.
Flynn szerint a másik fontos különbség a célkitűzésben mutatkozik meg: Zawahiri véletlenszerűen, Bagdad belvárosában gyilkolt, al-Baghdadi viszont sokkal pontosabban és okosabban választ célpontot.
Azzal kapcsolatban, hogy miként léphet fel a Nyugat az Iszlám Állam ellen, úgy vélekedett: nem lehetünk sikeresek pusztán légi csapásokkal, állomásozó csapatok kellenek a helyszínre. De a katonai fellépés nem vet véget mindennek. Biztonság és stabilitás kell, s az, hogy elősegítsük a menekültek visszatérését. Ez nem lesz gyors folyamat. Először is meg kell semmisíteni a szervezet teljes vezetését, szétzúzni hálózatukat, megállítani a finanszírozási műveleteket, és maradni, míg létre nem jön egyfajta normalitás. Ez természetesen nem hónapok, hanem évek kérdése – mondta Flynn.
2004 februárjában al-Baghdadi egy katonai táborban raboskodott, de az amerikai katonai bizottság úgy vélte, ártalmatlan. Arra a kérdésre, hogy hogyan kerülhetett sor ilyen végzetes hibára, Flynn azt mondta: „Túl hülyék voltunk”, és nem értettük, ki volt ő abban a pillanatban. Amikor 9/11 bekövetkezett, a válaszunk az volt: „Honnan jöttek ezek a rohadékok? Öljük meg őket.” Ahelyett, hogy megkérdeztük volna, miért támadtak ránk, azt kérdeztük, honnan jöttek, és emiatt stratégiailag rossz irányba indultunk – tette hozzá. Először Afganisztánba mentünk, ahonnan az al-Kaida indult, majd Irakba mentünk. Nem tettük fel magunknak a kérdést, hogy ez miért történt meg, hanem helyszíneket kerestünk. „Ez egy fontos lecke, amit meg kell tanulnunk, hogy ezeket a hibákat többé ne kövessük el.”
