A bíró a tárgyaláson ettől függetlenül egymillió dolláros óvadékot szabott ki a gyanúsítottra, mivel Dylann Roof ellen lőfegyver birtoklása miatt is indítottak eljárást. A 21 éves, fehér, munkanélküli Roof a rendőrségnek elismerte, hogy szerda este ő ölt meg kilenc afroamerikai hívőt Charleston egyik, feketék által látogatott, nagy múltú metodista templomában. A gyanúsítottat pénteken zárt láncú televízión kapcsolták a tárgyalóterembe, ahol jelen voltak az áldozatok hozzátartozói. Többen közöttük kijelentették, hogy megbocsátottak Roofnak, és megbánásra szólították fel. „A nagyapámat a gyűlölet ölte meg. A gyűlölet nem fog győzni” – mondta a meghallgatáson Daniel Simmons meggyilkolt lelkipásztor lányunokája.
Az igazságügyi minisztérium pénteken közölte: vizsgálja, hogy a charlestoni mészárlás gyűlölet-bűncselekmény mellett nem minősíthető-e egyúttal belföldi terrorcselekménynek is. Ha bűnösnek találják, Roofot halálra ítélhetik. Nikky Haley, Dél-Karolina republikánus kormányzója felszólította az ügyészséget, hogy a legsúlyosabb büntetés kiszabását kezdeményezze. Barack Obama elnök az amerikai polgármesterek pénteki, San Franciscó-i tanácskozásán kijelentette: a rasszizmus továbbra is „métely” az Egyesült Államokban, amely ellen közös összefogással kell harcolni. Megismételte, hogy támogatja a lőfegyverek beszerzésére és tartására vonatkozó szabályok szigorítását, és párbeszédet sürgetett az ügyben, mert, mint mondta, a dél-karolinaihoz hasonló esetek nyomán a gyászon kívül cselekvés is szükséges.
A gyanúsított hónapokig készült a támadásra, egy barátja szerint célja egy „faji háború” kirobbantása vagy a faji szegregáció visszaállítása volt Amerikában. Szemtanúktól származó értesülések szerint Roof azt kiabálta a templomban, hogy a feketéket lelőni ment oda, mert azok megerőszakolják a fehérek nőit és elveszik az országukat. Egy közösségi oldalon közzétett fotóján Roof a dzsekijén az apartheidkori Dél-Afrika és Rhodesia (ma Zimbabwe) zászlaját viselte.
Roofot 14 órányi üldözés után az észak-karolinai Shelbyben fogták el. Dylann Roof Columbiába való, amely kétórányi autóútra van Charlestontól. Februárban a columbiai rendőrség kábítószer birtoklása miatt őrizetbe vette, majd márciusban újabb elfogatási parancsot adott ki ellene, ismeretlen okból. Április 26-án a helyi Columbiana Centre bevásárlóközpont kihívta ellene a rendőrséget, mert egy korábbi kitiltása dacára megjelent az épületben. A nagyapja szerint a gyanúsított az áprilisban betöltött 21. születésnapja alkalmából egy .45-ös kaliberű kézi lőfegyvert vásárolt magának a családtól ajándékba kapott pénzből.