A védelmi tárca vezetőjeként ekkor Izrael határait biztosítandó támadást indított Libanon ellen, hogy kisöpörje onnan a Palesztin Felszabadító Szervezet harcosait; itt az eredeti tervektől eltérően egészen Bejrútig nyomult az ország területére. Védelmi miniszteri pozícióját azonban aláásta, hogy ekkor hagyta, hogy a szabrái és satílái menekülttáborokban palesztinokat öljenek halomra a libanoni falangisták, ezért tárca nélküli miniszterré fokozták le.
Saron az izraeli telepek építésével kívánta elérni azt, amit a hadsereg nyomásgyakorlásával igencsak költséges lett volna: a Nyugati part magaslatainak és stratégiai pontjainak izraeli felügyeletét; az első telepesek már a hatnapos háború után megjelentek a megszállt területeken, igazi lökést azonban Saron minisztersége adott nekik.
Politikai pályája azonban töretlenül folytatódott: 1984 és 1990 között Simon Peresz kormányának kereskedelmi és iparügyi minisztere lett, ezalatt megkötötte az Amerikai Egyesült Államokkal a szabad kereskedelmi egyezményt.
1990–92 között építésügyi és lakásügyi miniszter Jichak Samir kormányában, ekkor felgyorsította a zsidó telepek építését a megszállt területeken, és ezzel még népszerűtlenebbé vált. Így 144 ezer lakás épült, főként a Szovjetunióból bevándorló zsidók számára.
1992 és 1996 között a knesszet külügyi és védelmi bizottságában vállalt tisztséget, 1996–98 között nemzeti infrastruktúra-fejlesztési minisztere, 1998–1999 között külügyminiszter. Ez alatt az úgynevezett Flagship Water projekten dolgozott, amelyet az ENSZ anyagilag támogatott, hogy a régió vízproblémájára hosszú távú megoldást találjanak és megtalálják a békés kapcsolatok rendezését Izrael, Jordánia és más közel-keleti ország között. 1999. május 27-én Netanjahu lemondott a Likud pártvezéri posztjáról és Saront választották meg a párt új elnökének, a 2001-es választásokon pedig elnyerte a miniszterelnöki posztot is.




