Rio hosszú időre visszanyúló szennyvízproblémája súlyosbodott az elmúlt évtizedben a lakosság, s különösen a várost övező hatalmas nyomornegyedekben élők számának gyarapodása miatt. Bár nemzetközi intézmények több száz millió dollárt adományoztak Brazíliának a gond megoldására, a csatornavíz túlnyomó részét szabadtéri árkokon keresztül olyan patakokba és folyókba eresztik, amelyek az olimpia helyszínéül szolgáló vizeket táplálják – az Olimpiai Parkot övező lagúnák Rio legfertőzöttebb vizei.
Az ottani vírusok miatt a helybeliek szervezete antitesteket alakít ki, ám a külföldi sportolók és turisták nem immúnisak. A riói olimpia több száz sportolója a Guanabara-öböl, a Rodrigo de Freitas-tó és a Copacabana tengerpart szennyezett vizein versenyez majd. Hacsak addig nem talál ki valamit nagyon gyorsan az olimpiai szervezőcsapat.
