Az ismételt választási eljárás kezdetén Merkely Béla, az egyetem Városmajori Szív- és Érgyógyászati Klinikájának igazgatója, aki korábban szintén pályázott a rektori tisztség betöltésére, visszalépett.
A megismételt választásra azért volt szükség, mert az egyetem szenátusának 2015. április 8-i ülésén hozott, szintén Szél Ágostont jelölő határozatával szemben kifogással élt a Semmelweis Egyetem fenntartója, az Emberi Erőforrások Minisztériuma (Emmi).
Szél Ágoston a sajtótájékoztatón ismertette: az Emmi álláspontja szerint a korábbi szavazáson a reprezentatív szakszervezetek, illetve a közalkalmazotti tanács képviselőinek száma (2-2) a szenátus létszámához képest meghaladta a nemzeti felsőoktatásról szóló 2011. évi törvényben meghatározott 5-5 százalékos mértéket, mivel a szenátus létszáma a szavazás időpontjában 36 volt.
Kiemelte: a korábbi választás során a szenátus létszámának megállapításakor nem hiba történt, hanem az egyes jogi fogalmak tartalmát értelmezte eltérően a fenntartó és az egyetem. Az egyetemen a Testnevelési Főiskolai Kar leválása után a korábban negyvenfős szenátusi létszámból négy mandátum betöltetlenül maradt. A mostani választáson a szenátus tagjai közül a reprezentatív szakszervezetek, illetve a közalkalmazotti tanács által megválasztott és a választás napján delegált két-két tagból egy-egy fő mandátumát ideiglenesen visszavonta a delegáló szerv, így a szenátus létszáma 34 fő lett.
Szél Ágoston jelenlegi rektori megbízása 2015. június 30-án jár le. A felsőoktatási törvény értelmében a rektori megbízásra vonatkozó javaslatot a szaktárca vezetője küldi meg a köztársasági elnöknek, aki 2015. július 1-jével hároméves időtartamra bízza meg az új rektort.
