A bajnoki ezüstérmes Pick Szeged alapesetben az EHF-kupában indulhat, a szegediek azonban benyújtják jelentkezésüket a Bajnokok Ligája szabadkártyás selejtezőjére. A selejtező győztese a BL főtáblájára jut, míg a 2–4. helyezettek az EHF-kupában folytathatják a küzdelmeket.
A bajnoki és Magyar Kupa-bronzérmes Csurgó az EHF-kupában állhat rajthoz, míg a bajnoki 4. helyezett Grundfos Tatabánya a Challenge-kupában indulhat. Utóbbi együttes kéri besorolását az EHF-kupába, ugyanis a szabadkártyás selejtezők miatt egy csapat, amely eredetileg az EHF-kupában állt volna rajthoz, a szabadkártyás selejtezőből bejut a Bajnokok Ligájába, míg egy csapat, amely eredetileg a Challenge-kupában indult volna, a BL-be bejutó csapat helyén EHF-kupa-résztvevő lesz.
A női Bajnokok Ligájában a címvédő országa jogán induló 3. csapatról, valamint a szabadkártyás selejtezőben induló és a Challenge-kupából az EHF-kupába besorolt csapatokról az EHF végrehajtó bizottsága dönt.
Magyar indulók az európai kupákban, 2013/2014:
Nők:
Bajnokok Ligája, főtábla (1. kalap): Győri Audi ETO (BL-címvédő, magyar bajnok)
Bajnokok Ligája, 2. selejtezőkör (1. kalap): FTC Rail Cargo Hungaria (magyar bajnoki 2.)
Bajnokok Ligája, 2. selejtezőkör vagy Bajnokok Ligája szabadkártyás selejtező vagy EHF-kupa: ÉTV Érd (magyar bajnoki 3.)
EHF-kupa: Vác (magyar bajnoki 4.), Fehérvár KC (magyar bajnoki 5., kizárólag akkor indulhat, amennyiben az ÉTV Érd a címvédő ország harmadik képviselőjeként szerepelhet a BL-selejtezőben)
KEK: Veszprém Barabás Duna Takarék (Magyar Kupa 3.)
Férfiak:
Bajnokok Ligája, főtábla (1. vagy 2. kalap): MKB Veszprém (magyar bajnok)
Bajnokok Ligája szabadkártyás selejtező vagy EHF-kupa: Pick Szeged (magyar bajnoki 2.)
EHF-kupa: Csurgó
EHF-kupa vagy Challenge-kupa: Grundfos Tatabánya
