A csoportkör sorsolásában Marcos Senna, a spanyol válogatottal 2008-ban Európa-bajnokságot nyerő korábbi Villarreal-középpályás segédkezett. De még mielőtt a sorsolásra került volna sor, nyilvánosságra került, hogy az Európa-liga előző szezonja legjobb játékosának Gerardo Morenót, a Villarreal spanyol válogatott csatárát választották az Európai Labdarúgó-szövetség ítészei.
Ami pedig a konkrét sorsolást illeti: először az első kalapos csapatokra került sor. A Monaco a B–, a Napoli a C–, az Olympiakosz a D–, a Lazio az E–, a Braga az F–, a Leverkusen a G–, a Dinamo Zagreb a H–csoportba került. Majd jöttek a második kalaposok: a skót rekordbajnok, a Rangers a francia Lyonnal került egy csoportba, a holland PSV a Monacóval, az angol Leicester az olasz Napolival, az orosz Lokomotiv Moszkva az olasz Lazióval, a német Frankfurt a görög Olympiakosszal, a szerb Crvena zvezda a portugál Bragával, a skót Celtic a német Leverkussenel, a belga Genk pedig a horvát Dinamo Zagrebbel.
A spanyol Real Sociedad a Monaco és a PSV mellé került, kiegyenlített a csoport. Szalai Attila csapata, a Fenerbahce az Olympiakosszal és a Frankfurttal csap össze.
Végezetül a negyedik kalapos csapatok helye derült ki. A Ferencváros a G jelű négyesbe kapott besorolást: Peter Stöger csapata a Betis, a Celtic és a Leverkusen csapatával játszhat az Európa-liga csoportkörében. A csoportelső továbbjut a legjobb 16 közé, a nyolc csoportmásodik rájátszást vív a BL-ből érkező ottani nyolc csoportharmadikkal a nyolcaddöntőbe jutásért; a nyolc csoportharmadik az Európa-konferencialigában folytatja.
Az Európa-liga csoportkörének beosztása:
A CSOPORT
Olympique Lyon (francia)
Rangers (skót)
Sparta Praha (cseh)
Bröndby (dán)
B CSOPORT
Monaco (francia)
PSV Eindhoven (holland)
Real Sociedad (spanyol)
Sturm Graz (osztrák)
C CSOPORT
Napoli (olasz)
Leicester City (angol)
Szpartak Moszkva (orosz)
Legia Warszawa (lengyel)
D CSOPORT
Olympiakosz Pireusz (görög)
Eintracht Frankfurt (német)
Fenerbahce (török)
Antwerp (belga)
E CSOPORT
Lazio (olasz)
Lokomotiv Moszkva (orosz)
Olympique Marseille (francia)
Galatasaray (török)
F CSOPORT
Braga (portugál)
Crvena zvezda (szerb)
Ludogorec (bolgár)
Midtjylland (dán)
G CSOPORT
Bayer Leverkusen (német)
Celtic (skót)
Real Betis (spanyol)
Ferencváros (magyar)
H CSOPORT
Dinamo Zagreb (horvát)
Genk (belga)
West Ham United (angol)
Rapid Wien (osztrák)