A második fordulóba a két legjobb eredményt elért induló jutott: az ellenzéki liberálisok jelöltje, Zuzana Caputová, aki az első körben a szavazatok 40,57 százalékát szerezte meg, illetve a második helyen végzett Maros Sefcovic a szavazatok 18,66 százalékával, aki a legerősebb kormánypárt, az Irány (Smer-SD) támogatásával indult.
A voksolás szombaton reggel hétkor kezdődött és a tervek szerint este tízig tart. Az első részeredményeket a szavazóhelyiségek bezárását követően hozzák nyilvánosságra, a nem hivatalos végeredmény hajnalban, a hivatalos végeredmény vasárnap délben várható.
