Ezzel egy időben inkább a rendőrséget foglakoztatta a sztár, amely családjának biztosítására személyes védelemet rendelt el, miután Effenberget gyilkossággal fenyegették. A játékos a Playboy magazinnak adott nyilatkozatában becsmérlően beszélt a munkanélküliekről, és a segélyek radikális csökkentését követelte: „Közülük sokan szemmel láthatóan olyan jól élnek, hogy nincs kedvük kora reggeltől estig gürcölni, mindössze azért, hogy havonta szerény száz euróval többet keressenek!”
A négymillió munkanélkülit számláló országban ilyen megállapítás csak vihart válthat ki – különösen akkor, ha az olyan személytől származik, akit évente közel ötmillió euróval honorál a klubja.
A kereszténydemokrata kancellárjelölt és bajor miniszterelnök Edmund Stoiber éppúgy nemtetszésének adott kifejezést, mint a zöldek elnöke, Claudia Roth és a szakszervezetek élén álló Frank Bsirske.
A Bayern München kénytelen volt reagálni. Ottmar Hitzfeld edző közölte a játekossal, hogy törli a keretből, mert a bajnokság hajrájában a csapat nem teheti ki magát annak, hogy Effenberg miatt maga ellen hangolja a szurkolókat.
A „bőrnadrágosok” hajdani szakvezetője, Udo Lattek így vélekedett: „Stefan mindenütt nézeteltéréseket vált ki, minden együttest tönkretesz. Hitzfeld túl sokáig kitartott mellette.” A Bayern-alelnök, Karl-Heinz Rummenigge leszögezte: „Nem az ő feladata, hogy a munkanélküliség problémájával foglalkozzon, károkat okozott az egyesület tekintélyének.” A klub vezetői igyekeznek tartózkodóan állást foglalni, tekintettel a sikerekre, amelyeket a Bayern Effenberggel aratott. Ezen időszakban a klub háromszoros bajnok, Német Kupa- és Bajnokok Ligája-győztes lett.
Az eredményekkel szemben állnak a játékos botrányai. 1994-ben eltávolították a válogatottból, mert trágár módon sértegette a szurkolókat; 1995-ben és 1997-ben kétszer állt bíróság előtt könnyű testi sértés vádjával; 1998-ban ittas vezetés miatt elvették a jogosítványát, az egyesület tízezer márkás büntetést szabott ki rá; 2000-ben egy müncheni diszkóban állítólag megütött egy nőt, Effenberg százhuszonötezer márka bírságot és huszonkétezer márka fájdalomdíjat fizetett azért, hogy az ellene indított eljárást megszüntessék.
Nem vitás, hogy pályafutása a Bundesligában véget ért. A hírek szerint angol egyesületekkel tárgyal. A „bőrnadrágosok” legfeljebb az utolsó bajnoki fordulóban, a Rostock ellen nyújtanak neki lehetőséget arra, hogy még egyszer pályára lépjen a klub színeiben.
Vége a gólínségnek, két és fél év után talált a kapuba a válogatott csatár
