Ma is akad, aki az egyházi iskolák növekvő népszerűsége mögött (kétszer annyian járnak felekezeti intézménybe, mint 2010-ben) a szegregációt látja. Szerintük ugyanis ezek az iskolák azzal szédítik a szülőket, hogy itt a gyerekeiknek nem kell cigány tanulókkal egy osztályba járniuk.
Hogy ez mennyire fals, arra jó példa a nyíregyházi Huszár-telepen működő görög katolikus Sója Miklós Általános Iskola esete. A jogvédő CFCF (Esélyt a Hátrányos Helyzetű Gyermekeknek Alapítvány) azért kötött bele a működtető egyházba 2007-ben, mert szerinte az iskola „szegregál”: főként cigány gyerekek vannak az osztályokban Több se kellett az akkori szocialista önkormányzatnak, nyomban lakatot rakott az intézményre – csak a környéken élő családok véleményét felejtette el megkérdezni. (Szinte csak cigányok laknak arrafelé.) Ha megkérdezte volna, jó-e nekik, ha ezentúl buszozni, gyalogolni kell a másik iskoláig, alighanem dolguk végezetlenül távoztak volna a messziről jött jogvédők. (Márpedig az nagy baj, nekik ugyanis állandóan a jogot kell védeniük – akkor is, ha azt nem bántja senki ) Egyébként az égvilágon senki sem hívta őket a messzi Nyíregyházára, maguktól jöttek nyavalyogni az előre gyártott szegregálós szöveggel. Azóta szerencsére helyreállt a rend a Huszár-telepen, többfordulós bírósági hercehurca után a Kúria jogerősen elutasította a tenyérbe mászó jogvédők óhaját, hogy mondja ki a magas bíróság: a görög katolikus iskola szegregálja a gyerekeket. Az aggodalmaskodók persze jelezték: nem nyugszanak, nemzetközi fórumokon folytatják. Ha úgy alakul, az Atyaúristent is fölkeresik.
