Mucsi János a Novák Ferenc „Tata” vezette Bihari János Táncegyüttes emblematikus táncosa volt, majd a Zalka Táncegyüttes művészeti vezetője. 1991-től 2007-ig volt a BM Duna Művészegyüttes művészeti igazgatója, ahol vezetése alatt az együttes repertoárja a legmagasabb művészeti elvárásoknak megfelelően alakult át. Munkásságának köszönhetően emelkedett vissza a Duna Művészegyüttes a hivatásos társulatok számára kötelező rangra. Alkotói pályafutása alatt mindig nyitott és érdeklődő volt más népek kultúrája felé, illetve a hasonlóan igényes, akár kortárs táncművészeti alkotók munkái iránt is. Irányításával a BM Duna Művészegyüttes menedzsmentje volt a megvalósítója a Kultúra 2000 európai uniós projektnek, amely a nemzetközi együttműködési kapcsolatok elősegítését, valamint az Európa-szerte működő kulturális szervezetek összefogását erősítette.
Alapítóelnöke volt az 1996 óta minden nyáron megrendezett kulturális rendezvénysorozatnak, a Duna Karnevál Nemzetközi Kulturális Fesztiválnak. A karnevált a jövő évben már 30. alkalommal rendezik Mucsi János feleségének, Vincze Andrea alelnöknek vezetésével. A fesztivál tehát immár három évtizede elmaradhatatlan színfoltja a budapesti nyár kulturális palettájának.
Mucsi János a hazai néptáncmozgalom országos fesztiváljain, a Szolnoki Néptánc Fesztiválon, valamint a Zalai Kamara Táncfesztiválon számos alkalommal nyert koreográfiáival díjakat. Magas szakmai elismerésekben részesült különböző nemzetközi fesztiválokon (pl. Finnország, Lengyelország, Németország, USA), számos alkalommal tanított, koreografált és zsűrizett külföldön (pl. Törökországban, Hollandiában, Lengyelországban, Olaszországban, Finnországban). Aktív alkotói pályafutása során rendszeresen hívták jelentős nemzeti ünnepek programjainak koreografálására, rendezésére is, de koreográfusi munkáival rendszeresen találkozhatott a közönség nagy volumenű színházi produkciókban is.
Mucsi János számos állami kitüntetés birtokosa volt. 1997-ben megkapta a kitüntető Magyar Köztársasági Arany Érdemkeresztet, 1998-ban pedig a magyar táncszakma legmagasabb elismerésében, a Harangozó Gyula-díjban részesült. 2005-ben a Magyar Köztársasági Érdemrend Lovagkeresztjét, 2012-ben a köz szolgálatáért érdemjel arany fokozatát vehette át. 2014-ben a Magyar Érdemrend Tiszti keresztjével, 2018-ban pedig Magyarország érdemes művésze elismeréssel díjazták munkásságát. 2020-ban a tánc világnapja alkalmából a Magyar Táncművészek Szövetsége Életmű-díjban részesítette.