Az államtitkárság korábbi közleményében hangsúlyozta: a kancellári rendszer bevezetésének célja, hogy a felsőoktatási intézmények gazdálkodása felelősebb és átláthatóbb legyen.
Ellenzéki pártok ugyanakkor bírálták a kancellári rendszer bevezetését. Az MSZP, a DK, az Együtt–PM és a Jobbik is a felsőoktatási intézmények önállóságának csorbítását látja a rendszerben, utóbbi az Alkotmánybírósághoz fordulna, és ehhez a más frakciók támogatását kérte.
A Magyar Rektori Konferencia elnöksége szerint kockázatot jelent a felsőoktatási intézményekben a kettős vezetés.
