A felmentő ítéletek indoklása során a különleges háromtagú bíróság vezetője, Ružena Sabová kifejtette: amennyiben nem lehet valakinek a bűnösségét minden kétséget kizáróan bizonyítani, akkor fel kell menteni a vádak alól. A felvidéki magyar nyelvű hírportál, a Paraméter idézte indoklás szerint bár a volt titkosszolgálati tiszt, Peter Tóth tanúként elmondta a bíróságon, hogy Kočner arról beszélt neki, csak egy újságírót kéne meggyilkolni, aztán a többi visszafogná magát, viszont az, hogy ez valóban megtörtént, nem bizonyítható. A bíróság előtt nem kétséges, hogy Marián Kočner Ján Kuciak és más újságírók befeketítését tervezte, finanszírozta megfigyelésüket. Azt viszont, hogy ez összefügg a gyilkossággal, nem bizonyították egyértelműen, ahogy szerintük azt sem, hogy Alena Zsuzsová a szóban forgó bűncselekményről vagy bármilyen más gyilkosságról kommunikált volna Marián Kočnerrel. Az ítélet szerint azt, hogy a Kuciak-gyilkosságot Marián Kočner rendelte meg, csak egy másik vádlott, Andruskó Zoltán beismerő vallomása tanúsítja, és ezt az állítást semmi más nem erősíti meg. Azt sem sikerült egyértelműen bizonyítani, hogy az Andruskó által Szabó Tamásnak adott negyvenezer euró Kočnertől származik.