Debrecenben hamar gyökeret vertek a reformáció gondolatai: huszonegy évvel azután, hogy Luther Márton 1517. október 31-én (mely ma a reformáció emléknapja) közzétette 95 tételét a bűnbocsátó cédulákkal kapcsolatban, már nemcsak a református vallás hódította meg a várost, hanem 1538-ban működni kezdett iskolája is, a református kollégium. Nyilvánvalóvá lett, hogy az oktatáshoz és a tudományos munkához is szükséges könyvtár létesítése. A nyugat-európai országokba peregrinációra, vándordiákoskodásra induló hallgatók mindegyike hozott magával egy-két új nyomtatványt, amelyeket hagyományosan felajánlottak az alma mater könyvtárának. A professzorok kötelességüknek érezték, hogy könyveket adományozzanak, és saját könyvtáraik anyagát a kollégiumi könyvtárnak ajánlják fel. A hagyomány máig él, legutóbb egy hét alatt három műtárgyat is kaptak hagyatékokból a kollégiumi gyűjtemények.
Ahogyan a humaniórák oktatásához a könyv, ugyanúgy a természettudományok tanításához a kísérleti eszközök nélkülözhetetlenek. Így e tudományok neves oktatói – például Hatvani István, a „magyar Faust” – arra törekedtek, hogy elkészíttessék vagy beszereztessék őket. Ezek adták az évszázadok alatt kialakult gyűjtemények alapjait. Ahogyan teltek-múltak az évek, úgy váltak múzeumi tárggyá a hajdani osztálytermek, kollégiumi szobabelsők, az itt tanuló, később nemzetünk nagyjaivá lett személyiségek rekvizitumai. A közelmúltban zárult az a sok milliárd forintos felújítás, amelynek részeként e gyűjtemények magasabb színvonalon, sok esetben interaktívan is elérhetővé váltak.
Gáborjáni Szabó Botond igazgató ezer szállal kötődik a könyvtárhoz, a gyűjteményekhez és magához a kollégiumhoz is. Felmenői közül sokan itt végeztek. Például nagyapjának a testvére volt a tiszaszőlősi lelkész, Gáborjáni Szabó Gábor. (Utóbbinak aláírása szerepel az én nagyapám 1943-as anyakönyvi kivonatán is.) Gáborjáni Szabó Kálmán festő és grafikus is e család tagja volt. Itt tanult, ide jött vissza, itt készítette el a kollégium fennállásának 400. évfordulójára az intézmény ősi életéről szóló freskósorozatot, amelyen meg van örökítve például Csokonai Vitéz Mihály. S azt sem tudja mindenki, hogy Szabó Lőrinc költő is Gáborjániként, G. Szabó Lőrincként kezdte meg tanulmányait az alma materben. 1914-es fényképen látható egy iskolai rendezvényen, ógörög nyelven előadott dráma szereplőjeként.